導(dǎo)讀:近日,印度尼西亞加查馬達(dá)大學(xué)的研究人員及Trisna Julian等人組成的研究團(tuán)隊(duì),開發(fā)了一款低成本、非侵入、可快速“嗅出”新冠肺炎的便攜式電子鼻
據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,近日,印度尼西亞加查馬達(dá)大學(xué)(Universitas Gadjah Mada)的研究人員及Trisna Julian等人組成的研究團(tuán)隊(duì),開發(fā)了一款低成本、非侵入、可快速“嗅出”新冠肺炎(COVID-19)的便攜式電子鼻(GeNose C19),該電子鼻集成了金屬氧化物半導(dǎo)體氣體傳感器陣列、優(yōu)化的特征提取方法和機(jī)器學(xué)習(xí)模型。
2019年底,中國湖北省武漢市出現(xiàn)了新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)引發(fā)的新冠肺炎(COVID-19),隨后全球200多個(gè)國家和地區(qū)相繼爆發(fā)新冠疫情,并不斷升級。COVID-19大流行嚴(yán)重威脅老年群體和免疫功能低下人群的生命。自疫情爆發(fā)以來,逆轉(zhuǎn)錄-定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR)方法一直被用于COVID-19常規(guī)性檢測及診斷。
發(fā)達(dá)國家的醫(yī)療資源豐富,大規(guī)模RT-qPCR檢測已成為其篩查和流行病學(xué)控制的一種普遍手段。然而,對于發(fā)展中國家,尤其是中低收入國家來說,這些檢測太奢侈了。但是,阻止大流行蔓延意味著要確保全球所有國家在有選擇地進(jìn)行隔離和控制的前提下,都有能力繼續(xù)進(jìn)行大規(guī)模和快速的篩查。
為了克服RT-qPCR作為篩查工具的局限性,一些臨床醫(yī)生和研究人員嘗試結(jié)合使用臨床體征和癥狀、實(shí)驗(yàn)室檢測、影像學(xué)測量(例如胸部計(jì)算機(jī)斷層掃描)和多變量臨床預(yù)測模型,包括電子鼻,以及RT-qPCR來驗(yàn)證臨床診斷結(jié)果。
在該項(xiàng)研究中,研究人員通過集成金屬氧化物半導(dǎo)體氣體傳感器陣列、機(jī)器學(xué)習(xí)分析和呼吸采樣設(shè)置,開發(fā)了一種便攜式呼吸分析儀——電子鼻,稱為“GeNose C19”(如下圖所示)。該定制系統(tǒng)被用于對印度尼西亞兩家醫(yī)院中兩組不同受試者(即RT-qPCR確診的COVID-19陽性患者組和陰性受試者組)的臨床測試進(jìn)行分析,以研究其區(qū)分這兩個(gè)不同受試組呼吸模式的潛力。研究人員檢查了四種不同的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,以確定所開發(fā)設(shè)備的最高可能精度。
利用集成人工智能(AI)的便攜式電子鼻GeNose C19快速、非侵入檢測COVID-19
用于COVID-19檢測的電子鼻GeNose C19
集成到電子鼻GeNose C19中用于“嗅出”COVID-19的電子和機(jī)械組件分為兩個(gè)主要部分(即傳感和呼吸采樣單元),如下圖a、b所示。前者由密封在微型化腔室中的化學(xué)電阻傳感器陣列、微型泵、三通電磁閥、電源和數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)組成。它們都被放置在一個(gè)3D打印的外殼中。后者包括一個(gè)高效空氣過濾器(HEPA)和一個(gè)由醫(yī)用級聚氯乙烯制成的一次性空氣采樣袋。這兩部分均單獨(dú)設(shè)計(jì),然后通過外徑為4mm的柔性醫(yī)用級聚四氟乙烯(PTFE)管連接,以便在氣體傳感過程中保持氣流通暢(下圖c)。該裝置中,高效空氣過濾器連接在儲液袋和GeNose C19入口之間,濾出含新冠肺炎病毒的飛沫。此外,它還具有吸水元件,以消除對氣體傳感器干擾最大的水分子(圖d)。因此,只有目標(biāo)揮發(fā)性有機(jī)化合物(VOCs)會(huì)進(jìn)入傳感室,因?yàn)椴《緯?huì)被含有纖維墊的過濾器捕獲(圖e、f),并且防止其污染GeNose C19機(jī)器中整個(gè)空氣軌跡。
GeNose C19系統(tǒng)及其組件
呼吸氣體的傳感器特性
當(dāng)沒有呼吸通過管道進(jìn)入測試室時(shí),首先測量傳感器基線值(即對應(yīng)環(huán)境條件的傳感器信號)。然后將它們作為對含揮發(fā)性有機(jī)化合物呼吸的輸出響應(yīng)信號的參考基數(shù)。氣體分子與化學(xué)電阻傳感器的活性層表面相互作用后,由于電阻降低,它們的輸出電壓增加。所有傳感器在40s內(nèi)同時(shí)進(jìn)行傳感測量,以達(dá)到其飽和階段。通常,對于金屬氧化物半導(dǎo)體氣體傳感器來說,由于活性材料(例如N型二氧化錫)和氣體分子之間的氧化還原反應(yīng),其電導(dǎo)率將在目標(biāo)氣體存在時(shí)發(fā)生變化?;诒砻婊瘜W(xué)吸附氧反應(yīng)的平衡位移對揮發(fā)性有機(jī)化合物的詳細(xì)傳感機(jī)制已在其它研究中進(jìn)行了描述。本研究中,材料表面的耗盡區(qū)由目標(biāo)揮發(fā)性有機(jī)化合物控制,導(dǎo)致自由電荷載流子(即在N型二氧化錫活性層的自由電子)從金屬氧化物半導(dǎo)體到氧的移動(dòng)發(fā)生變化,反之亦然。
GeNose C19在COVID-19分析測試中的性能
GeNose C19被用于兩家醫(yī)院(即斯萊曼的Bhayangkara綜合醫(yī)院(RS Bhayangkara)和班圖爾的Bambanglipuro COVID-19特殊野戰(zhàn)醫(yī)院(RSLKC Bantul))的COVID-19分析測試,以研究其對檢測COVID-19的效力和功能。本次研究招募了83名受試者,其中確診為COVID-19陽性(病例組)的受試者43名,檢測為COVID-19陰性(對照組)的受試者40名(下圖)。其中,病例組因病情惡化排除了2名受試者,這兩名受試者被轉(zhuǎn)診至高水平的醫(yī)療機(jī)構(gòu)。
通過機(jī)器學(xué)習(xí)進(jìn)行測量的呼吸數(shù)據(jù)分析
本次研究方法在分析測試中進(jìn)行了評估,共涉及615個(gè)呼吸樣本,其中333個(gè)陽性樣本和282個(gè)陰性樣本。樣本分別來自43名COVID-19陽性患者和40名陰性受試者,并在印度尼西亞日惹特區(qū)的兩家醫(yī)院進(jìn)行了RT-qPCR確認(rèn)。研究者利用四種不同的機(jī)器學(xué)習(xí)算法(即線性判別分析、支持向量機(jī)、堆疊多層感知器和深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò))識別出性能最好的模式識別方法,并從測試數(shù)據(jù)集獲得較高的系統(tǒng)檢測精度(88%~95%)、靈敏度(86%~94%)和特異性(88%~95%)水平。本次研究結(jié)果表明,電子鼻GeNose C19可以作為一種非常有潛力的COVID-19快速篩查測試儀。